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尊龙凯时人生就博:无须培养的全亚型结核耐药基因靶向NGS方案

发布时间:2025-02-25   信息来源:柯江晴

结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)是一种重要的全球致病菌,导致的结核病是一种高致死率的疾病。标准株H37Rv于1998年完成测序,基因组大小约为44Mb,包含3900多个蛋白编码基因。结核分枝杆菌可分为7个主要谱系,已知的耐药基因包括embB、rpoB、gyrA等。

尊龙凯时人生就博:无须培养的全亚型结核耐药基因靶向NGS方案

在2023年10月17日,世界卫生组织(WHO)发布了《应用新一代测序检测技术开展耐药结核病监测的实施性手册》。WHO认为新一代测序(NGS)技术能够提供全面的耐药谱系检测,降低对表型药敏检测的依赖,尤其是对于那些表型药敏检测试剂不可靠的药物而言,意义重大。NGS技术有望为结核病的治疗方案提供更加全面的耐药谱检测,从而提升化疗方案的精准性。

由于结核杆菌的基因组较大,目前许多靶向结核NGS方法(tNGS)未能全面覆盖所有亚型及耐药基因。虽然全基因组测序(WGS)可以覆盖整个基因组,但其可靠性依赖于培养物。为此,尊龙凯时人生就博推出的QIAseq x HYB Mycobacterium Tuberculosis Panel试剂盒,能够在无需培养的情况下实现结核全基因组的靶向建库,并覆盖7种主要谱系亚型及所有已知的耐药基因。

QIAseq x HYB Mycobacterium Tuberculosis Panel依托于杂交捕获技术,支持使用痰液、脑脊液、粪便等样本进行结核全基因组测序,使用量仅需10ng起始DNA,无需提前培养。高特异性和灵敏度的捕获探针,即使在低拷贝样本中,也能实现基因组的高覆盖,尤其是PE/PPE基因区域,同样能够实现均匀的高深度覆盖,从而有效分型。

获取TB全基因组数据后,用户可以利用CLC Genomics Workbench的结核分枝杆菌分析工具,快速完成质量控制、序列比对、谱系鉴定及耐药变异等分析。进一步的分析还包括变异注释与比较、变异对蛋白结构的影响评估、cgMLST分型、最小生成树及SNP tree构建等。

除了QIAseq x HYB Mycobacterium Tuberculosis Panel,尊龙凯时人生就博还推出了QIAseq x HYB Hep C Panel,用于丙型肝炎病毒的全基因靶向测序,覆盖所有丙型肝炎病毒亚型,并无缝整合CLC Genomics Workbench生物信息分析系统,实现一键获得分析结果。未来,QIAseq x HYB还将推出针对客户特定目标微生物的定制化靶向Panel,敬请期待!如需了解更多信息,请联系我们。